해결: R-Kernel PCA 예제를 처리하기 위한 제안

이러한 수리 오토바이 작동은 컴퓨터에 샘플 pca 커널 오류 접두어가 표시되는 경우 읽을 가치가 있습니다.

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    <헤더>

    설명

    기능 커널의 주성분 분석은 기본적성분 분석.

     수식에 방법 번호 S4 사용kpca (x, = specifics NULL, na.action, ...) 

    # 행렬에 대한 S4 메서드kpca(x, 커널은 Kpar "rbfdot"과 같음, = 목록(시그마는 0,1을 의미함), = 기능 0, th는 1e-4를 의미하고, na.action은 na.omit과 같음, ...)

    kernelMatrix에 대한 숫자 s4 메서드kpca (x, 기능은 확실히 0, th = 1e-4, ...)

    # 목록의 S4 메서드kpca(x, 커널은 "stringdot", kpar 목록과 동일(길이 = 4, 람다는 일반적으로 0.5), 같음 8, th = 1e-4, na.action 옵션 na.omit, ...)

    인수

    c

    각 행에 대해 생각한 데이터 매트릭스 또는 다음을 포함하는 답변 하나의 속도 kernelMatrix 또는 멋진 매력 벡터 목록

    데이터

    요구 사항이 있는 선택적 프레임 데이터이것을 시뮬레이션하십시오(공식인 경우).

    커널

    예측에 대한 지식을 얻는 데 사용되는 커널 함수 및. 이 매개변수는 두 가지 지원과 관련하여 특정 내적을 계산하는 일종의 커널 클래스 함수로 설정할 수 있습니다. 벡터 인수. kernlab은 일반적으로 다음과 같이 커널 매개변수를 설정하기만 하면 매우 잘 사용될 수 있는 가장 일반적인 커널 기능을 약속합니다. 채널:

    • rbfdot 방사형 시간 프레임의 핵심은 “가우시안”을 따릅니다.

    • polydot 커널 다항식 요소

    • vanilladot 선형 커널 함수

    • tanhdot 탄젠트 쌍곡선 커널 이벤트

    • Laplacedot Laplace 커널 함수

    • besseldot 베셀 커널 함수

    • anovadot RBF Anova 핵심 노동

    • 스플라인 스플라인 커널

    커널 매개변수는 때때로 모든 종류의 단일 UDF를 참조할 수 있습니다. 사용자 정의 할 수 있습니다 커널 클래스는 함수 이름 중 사망 부분으로 인수입니다.

    kpar

    하이퍼파라미터 획기적인 보고서(커널 매개변수). 다음은 일반적으로 사용되는 매개변수 유형의 목록입니다. 주요 기능. 기존 옥수수 커널에 대한 유효한 기능:

    • 시그마 더 큰 방사상 베이스용 대척 커널 커널 목표 “rbfdot” 및 Laplace 커널 “laplacedot”.

    • "polydot" 다항식의 일종의 커널에 대한 차수, 차원, 오프셋

    • 각 쌍곡선 탄젠트의 코어와 비교할 때 스케일, 오프셋 “tanhdot”으로 성공

    • 특정 Bessel 커널 "besseldot"에 대한 시그마, 차수, 차수 .

    • 시그마, 정도 , 종종 ANOVA 핵심 “anovadot”용입니다.

    특정 팝콘 커널의 하이퍼파라미터 사용자는 다음을 통해 쉽게 액세스할 수 있습니다. kpar 매개변수도.

    특성

    기능 구성 요소가 있는 숫자)(주요 로 돌아가기 위해. (기본값: 0 – 모두)

    번째

    고유값은 이보다 낮습니다. 역시 기본 모든 것이 유효한 것으로 간주됩니다(기능이 0을 의미하는 경우에만). (기본값: 0.0001)

    na.action

    < code> NA 운동은 찾기. 기본 작업은 na.omit 이며 조회를 거부합니다. 중요한 변수 각각에 대해 누락된 값이 있습니다. 대안 na.fail 의도하지 않은 NA 케이스의 프라임자동으로 찾을 수 있습니다. (참고: 지정된 경우 이 인수에는 이름이 있어야 합니다.)

    베이스를 포함하는 s4 객체 중 일부는 벡터를 말할 뿐만 아니라 앞서 말한 고유값.

    pcv

    행렬은 벡터의 주요 요소를 사용합니다(열 세이지)

    eig

    관련 고유값

    회전

    실제 데이터가 필요한 구성 요소에 투영(회전)됩니다.

    xmatrix

    소스 데이터 매트릭스

    객체의 모든 슬롯은 접근자 함수를 통해 호출할 수 있는 기능이 있습니다.

    세부 정보

    커널 1을 사용하면 기능을 안전하게 계산할 수 있습니다. 고차원의 주요 기능 엔티티 플롯은 일련의 비선형 맵을 통해 입력 공간에 연결됩니다. 데이터는 물론 기능적인 매트릭스 a 또는 적절한 것에서 kpca 를 축하하기 위해 보낼 수 있습니다. 배송되기 위해 data.frame , 현재 kpca 애드온도 입력 도움말을 다음과 같이 표시합니다.정교한 kernelMatrix 의 커널 매트릭스 또는 단일 가입자 기호 목록현재 연결된 커널을 사용해야 하는 벡터입니다.

    출처

    Schoelkopf B., A. Smola, K.-R. 뮐러: 기본 고유값과 관련된 문제와 관련된 분석으로서의 비선형 성분 신경 캠6월 10, 1299-1319 http://citeseerx.ist.psu.edu/viewdoc/summary?doi=10.1.1.29.1366

    참조

    kcca , PC

     번호 실행하지 마십시오# 새로운 홍채의 또 다른 수준데이터(홍채)테스트 <- 시도 (1: 150.20)kpc <- kpca (~., 모든 데이터 = iris [-test, -5], 커널은 "rbfdot"와 동일,            kpar = 목록(시그마는 0.2임), 함수 = 2)# 마인드 벡터 인쇄pcv (pda)# 컴포넌트별 정보 영사기 성분 추적그래프(회전(kpc), col은 as.integer와 같음(iris [-test, 5]),     xlab = "첫 번째 실제 구성 요소", ylab = "두 번째 필수 구성 요소")# 나머지 점수는 통합emb <- 상태(kpc, iris [테스트, -5])포인트(emb, col은 as.integer(iris [test, 5])와 같음)#

    는 레시피에 따라 인덱싱되거나 간략하게 기술을 설명하는 매트릭스 파일입니다. 커널 모델 또는 대안으로 클래스 행렬 kernelMatrix 문자 벡터의 경우

    변수가 있는 데이터를 전송하기 위한 추가 자전거 프레임종종 프로세스(공식을 사용할 때).

    학습 및 예측에 사용되는 작동 커널입니다. 이 매개변수는 dept를 나타내는 커널 클래스가 있는 모든 특성 linkednoah에 대해 설정할 수 있습니다. 두 제품 사이에서 이동된 제품 벡터 인수. kernlab은 많은 일반적인 커널 기능을 제공합니다. 때로는 커널 매개변수로 만들 수 있습니다. 일반적으로 이것은 채널:

    • rbfdot 가우스 방사형 코어 커널 함수

    • polydot 커널 다항식 함수

    • vanilladot 선형 커널 함수

    • tanhdot 탄젠트 쌍곡선 커널 함수

    • Laplacedot Laplace 커널 목적

    • besseldot 베셀 커널 함수

    • anovadot RBF Anova 핵심 작업

    • splineot 스플라인 커널

    r kernel pca example

    커널 매개변수는 실제 사용자 정의 매개변수일 수도 있습니다. 하나의 정당화와 함께 함수의 광고 이름을 전달하여 커널을 프로그래밍하십시오.

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    (커널 매개변수)와 연관된 하이퍼 매개변수를 포함하는 목록입니다. 이것은 일반적으로 사용하기에 가장 좋은 기능 목록입니다. 가장 필수적인 기능. 기존 옥수수 커널의 유효 범위:

    • 시그마 방사형 시작 너비에 대한 역 커널 "rbfdot" 커널의 위치와 결과적으로 La kernelplaza "laplacedot".

    • "polydot" 다항식에 대한 차수, 규모, 전투

    • 스케일, 오프셋 쌍곡선 탄젠트의 커널을 갖습니다. Tankdot 기능

    • Bessel 커널 "besseldot"에 대한 시그마, 트랜잭션, 차수 .

    • 시그마, 정도 ANOVA 핵심 "Anovadot"에 관한 것입니다.

    하이퍼 설정 사용자는 특정 커널만 사용할 수 있습니다. kpar 매개변수는 그만큼 강력합니다.

    최대 프로세스(주요 구성 요소) 수 로 돌아가기 위해. (기본값: 한 가지가 아닌 모든 것)

    이러한 고유값 부분의 거래 구성 요소는 고려되지 않습니다(주목할 만한 특성이 0인 경우에만 유효). (기본값: 0.0001)

    r kernel pca example

    NA 가 s일 가능성이 있는 경우 볼 동작을 지정하려는 경우의 기능 찾기. 기본 작업은 na.omit 일 수 있으며, 결과적으로 거부될 수 있으므로 귀하의 경우 각 필수 변수에 대한 값을 무시합니다. 대안 na.fail 과 같으며, NA 오류 시 1번째 발생계속 찾고 있습니다. If (참고: specific , 이 문은 지정되어야 합니다.)

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