Gelöst: Vorschläge Zur Linderung Des R-Kernel-PCA-Beispiels

Diese Reparaturbestimmungen sind lesenswert, wenn Sie eine Beispiel-PCA-Kernel-Fehlernummer auf Ihrem Computer erhalten.

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    Beschreibung

    Die Hauptkomponentenanalyse eines guten Kernels ist eine nichtlineare Form in Bezug auf die FundamentaldatenKomponentenanalyse.

    Verwenden Sie

     Methodennummer S4 für Formelnkpca (x, = kritische Information NULL, na.action, ...) 

    # S4-Methode für Matrixkpca (x, Kernel impliziert Kpar "rbfdot", = Liste (sigma impliziert 0,1), = bietet 0, th bedeutet 1e-4, na.action impliziert na.omit, ...)

    Zahl s4 Methode für kernelMatrixkpca (x, Features sollten 0 sein, th = 1e-4, ...)

    # S4-Methode zum Suchen der Listekpca (x, Kernel ist "stringdot", entspricht kpar list (Länge = 4, Lambda ist auch 0,5), gleich 4, th = 1e-4, na.action steht für na.omit, ...)

    Argumente

    z

    die für jede Zeile angebotene Datenmatrix oder ein Heilmittel mit Modellieren oder auch nur eine Kernel-Matrix mit einer neuen Geschwindigkeit kernelMatrix oder eine wichtige Liste von Charm-Vektoren

    Daten

    < p>

    optionale Rahmendaten mit Bedenken inSimulieren Sie dies (wenn Formel).

    Kernel

    Kernel-Funktion, die in Vorhersagen trainiert und verwendet wird. Dieser Parameter kann mit den meisten Kernel-Klassenfunktionen eingestellt werden, die Ihr Punktprodukt in Bezug auf zwei . berechnet Vektorargumente. kernlab besitzt die gebräuchlichsten Kernel-Features, die sehr gut verwendet werden können, indem ein Kernel-Parameter tatsächlich wie folgt eingestellt wird Kanäle:

    • rbfdot Der Kern des radialen Fundaments folgt dem “Gaußschen”

    • polydot Kernel-Polynom Ergebnisse anzeigen

    • Vanilladot Lineare Kernel-Funktion

    • tanhdot Tangenter hyperbolischer Kernelteil

    • Laplacedot Laplace-Kernel-Funktion

    • besseldot Bessel-Kernel-Funktion

    • anovadot RBF Anova Kernarbeit

    • splinedot Spline-Kernel

    Ein Kernel-Parameter kann sich manchmal auf die richtige einzelne UDF beziehen. kann angepasst werden Kernel-Klasse durch denise-Teil des Funktionsnamens nur als Argument.

    kpar

    Hyperparameterdokument (Kernelparameter). Hier ist eine Liste der meisten verwendeten Parametertypen Die Hauptfunktion. Gültige Ausgaben für vorhandene Maiskörner:

    • Sigma Umkehrung des Kernels für eine größere radiale Basis Kernel-Prozess “rbfdot” sowie Laplace-Kernel “laplacedot”.

    • Grad, Ausdehnung, Offset relativ zu diesem speziellen Kern des “Polydot”-Polynoms

    • Maßstab, Offset relativ zum Kern einer hyperbolischen Tangente Erfolge mit “tanhdot”

    • Sigma, Ordnung, Grad für einen bestimmten Bessel-Kernel “besseldot”.

    • Sigma, Grad , was zweifellos für den ANOVA-Kern “anovadot” ist.

    Hyperparameter-Benutzer für bestimmte Maiskörner sind leicht zugänglich über kpar-Parameter auch.

    Merkmale

    Nummer mit Merkmalskomponenten) (Haupt für Zurückgehen zu. (Standard: 0 – alle)

    th

    Eigenwert ist unten, ganz zu schweigen davon auch einfach Dinge werden als gültig vergessen (nur wenn Merkmale gleich 0 sind). (Standard: 0,0001)

    na.Aktion

    Funktion zum Festlegen von Prozeduren, die resultieren, wenn < code> NA Azines ist finden. Die Standardaktion ist na.omit , die speziell Treffer ablehnt. mit fehlenden Werten für jede einzelne wichtige Variable. Alternative na.fail am besten für unbeabsichtigte NA Fälleum am Ende gefunden zu werden. Wenn (Hinweis: angegeben, muss dieses wichtige Argument einen Namen haben.)

    Wert

    das s4-Objekt genau, das die Basis enthältEinige der tatsächlichen Vektoren, sowie die passenden Eigenwerte.

    pcv

    Matrix aus dem Hauptelement mit Vektoren (Spalte Salbei)

    eig

    Zugehörige Eigenwerte

    rotiert

    Ist-Daten werden auf gewünschte Komponenten projiziert (rotiert)

    xmatrix

    Quelldatenmatrix

    alle Slots von Objekten können durchaus über Accessor-Funktionen aufgerufen werden.

    Details

    Mit Kernel 1 lassen sich Funktionen gut berechnen Hauptmerkmale in High Dimension Entitätsdiagramme ähneln dem Eingaberaum durch die tatsächliche Reihe nichtlinearer Karten. Natürlich können Daten gesendet werden, um erfolgreich kpca in der jeweiligen Matrix a oder dem bestimmten zu feiern. geliefert werden data.frame , normalerweise bringt das Addon kpca auch Eingabehilfe alsKernelmatrix in Ihrer Klasse kernelMatrix oder als absolute Liste von AbonnentensymbolenVektoren, die die Verwendung eines verketteten Kernels erfordern.

    Quellen

    Schoelkopf B., A. Smola, K.-R. Müller: Nichtlineare Komponente als Analyse zu einem Problem mit Basiseigenwerten Nervenkamera10. Juni, 1299-1319 http://citeseerx.ist.psu.edu/viewdoc/summary?doi=10.1.1.29.1366

    Siehe auch

    kcca , PC

    Beispiele

     Zahl NICHT AUSFÜHREN# ein weiterer Fall einer neuen IrisDaten (Iris)Test <- Melodie (1: 150.20)kpc <- kpca (~., document = iris [-test, -5], Kernel entspricht "rbfdot",            kpar = Liste (Sigma bedeutet 0,2), Funktionen = 2)# Bewegungsvektor druckenPCV (PDA)# Verfolgen Sie das Informationsprojektormaterial nach Komponentegraph (Rotation (kpc), col gleich as.integer (Iris [-test, 5]),     xlab = "1. entscheidende Komponente", ylab = "2. fundamentale Komponente")# Restnoten werden integriertemb <- Schätzungen (kpc, Iris [test, -5])Punkte (emb, col ist gleich as.integer (iris [test, 5]))#

    ist eine Matrixdatei, die nach einer Strategie indiziert ist oder kurz eine Lösung beschreibt, die Kernel-Modell oder sogar Klassenmatrix kernelMatrix zusammen mit Fall von Zeichenvektoren

    zusätzlicher Fahrradrahmen zum Umschalten von Daten mit Variablen inoft ein Design und ein Stil (bei Verwendung einer Formel).

    Ein funktionierender Kernel, der nur für das Training und damit für Prognosen verwendet wird. Dieser Parameter kann aber auch für alle Show-Ergebnisse gesetzt werden, die mit einer Kernel-Klasse verbunden sind, die dept bestimmt. Produkt bewegte sich zwischen zwei Vektorargumente. kernlab bietet viele gängige Kernelfunktionen manchmal kann es mit einem Kernel-Parameter gemacht werden, der normalerweise diesem ähnlich ist Kanäle:

    • rbfdot Gaußsche radiale Kernkernfunktion

    • polydot Kernel-Polynomfunktion

    • Vanilladot Lineare Kernel-Funktion

    • tanhdot Tangentiale hyperbolische Kernelfunktion

    • Laplacedot Laplace-Kernel-Ziel

    • besseldot Bessel-Kernel-Funktion

    • anovadot RBF Anova Kernarbeit

    • splinedot Spline-Kernel

    r kernel pca example

    Ein Kernelparameter kann auch ein benutzerdefinierter Parameter sein Programmieren Sie den Kernel, indem Sie die Angabe der Funktion mit einem Fall übergeben.

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    Liste mit Hyperparametern, die mit (Kernelparametern) verknüpft sind. Dies ist normalerweise jede Liste von Funktionen, die getragen werden sollen Die mittlere Funktion. Gültige Bereiche für vorhandene Popcornkerne:

    • Sigma inverser Kernel für radiale Make-Breite Die Position des "rbfdot"-Kernels und folglich des La kernelplaza "laplacedot".

    • Grad, Skala, niedriger für das Polynom "Polydot"

    • Skalierung, Offset für den Kernel des hyperbolischen Tangens Tankdot-Ziel

    • Sigma, Einkauf, Abschluss für den Bessel-Kernel "besseldot".

    • Sigma, Grad einer Person bezüglich des ANOVA-Kerns "Anovadot".

    Hyper-Settings-Benutzer können nur für ausgewählte Kernel verwendet werden, um tatsächlich ausgeliefert zu werden Der Parameter kpar ist einfach so angenehm.

    Anzahl der Verhalten (Hauptkomponenten) bis zu Um zurückzukehren. (Standard: definitiv nichts, alles)

    der wahre Wert des Teils von im Allgemeinen Eigenwert unter dem Haupt Komponenten werden nicht angerechnet (gilt nur, wenn Nutzen gleich 0 ist). (Standard: 0,0001)

    r kernel pca example

    Funktion, wenn Sie die Aktion angeben möchten, die beibehalten werden soll, wenn NA ohne Zweifel s . ist finden. Die Standardaktion könnte na.omit sein, was zu einer Ablehnung führt, um Sie bei Fällen zu unterstützen mit verschobenen Werten für jede erforderliche Variable. Alternativeentspricht na.fail , was einen spezifischen Fehler auslöst NA Es ist schon lange zu finden. Wenn (Hinweis: zugewiesen , muss diese Anweisung angegeben werden.)

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